在CentOS6.4下编译MySQL5.6.16版本，直接编译MySQL源代码会出现一些问题，因此在这里备忘一下编译方法及修改事项。MySQL的编译过程如下：

$ sed -i "/ADD_SUBDIRECTORY(sql\/share)/d" CMakeLists.txt &&
$ sed -i "s/ADD_SUBDIRECTORY(libmysql)/&\\nADD_SUBDIRECTORY(sql\/share)/" CMakeLists.txt &&
$ sed -i "s@data/test@\${INSTALL_MYSQLSHAREDIR}@g" sql/CMakeLists.txt &&
$ sed -i "s@data/mysql@\${INSTALL_MYSQLTESTDIR}@g" sql/CMakeLists.txt &&
$ sed -i "s/srv_buf_size/srv_sort_buf_size/" storage/innobase/row/row0log.cc &&
$ mkdir build &&
$ cd build &&
$ cmake -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release                    \
         -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/mysql-5.6.16                   \
         -DINSTALL_MYSQLDATADIR=/srv/mysql             \
         -DINSTALL_SQLBENCHDIR=share/mysql/bench       \
         -DINSTALL_SUPPORTFILESDIR=share/mysql         \
         -DMYSQL_DATADIR=/srv/mysql                    \
         -DSYSCONFDIR=/etc/mysql                       \
         -DWITH_PERFSCHEMA_STORAGE_ENGINE=OFF          \
         -DWITH_EXTRA_CHARSETS=all                 \
         -DWITH_LIBEVENT=system                        \
         -DWITH_SSL=system                             \
         .. &&
make

TIPS:如果你对参数的设置不是很清楚，可以参看MySQL的官方文档： MySQL Source-Configuration Options

要是你能顺利完成编译，那恭喜。

Mitchell前后编译安装前后做过的修改和操作如下：

1. 修改: ./cmake/ssl.cmake 237:55
   在"${WITH_SSL_DOC}的错误，修改成" ${WITH_SSL_DOC}
   注意：双引号后面需要加个空格
2. 修改./CMakeLists.txt
   

   CMAKE_MINIMUM_REQUIRED(VERSION 2.6)
   # Avoid warnings in higher versions
   if("${CMAKE_MAJOR_VERSION}.${CMAKE_MINOR_VERSION}" GREATER 2.6)
      CMAKE_POLICY(VERSION 2.8)
      # Added by MitchellChu to dispose CMP0022 CMake Waning.
      # 这里检验cmake版本是否大于2.8.11，如果大于，把CMP002策略设置为OLD
      IF("${CMAKE_VERSION}" VERSION_GREATER "2.8.11")
         CMAKE_POLICY(SET CMP0022 OLD)
      ENDIF()
   endif()

3. 安装完毕添加my.cnf
   

   # install -v -dm 755 /etc/mysql &&
   cat > /etc/mysql/my.cnf <<"EOF"
   ###这里是你的cnf配置文件内容
   EOF

4. 初始化Mysql实例数据
   

   # /usr/local/mysql5.6.16/scripts/mysql_install_db --basedir=/usr/local/mysql5.6.16 --datadir=/srv/mysql/data --user=mysql&&
   chown -R mysql:srvuser /srv/mysql/data

5. MYSQL_UNIX_ADDR为默认的/tmp/mysqld.sock，还要配置下运行时的mysqld.sock和mysql.sock
   

   # install -v -o mysql -g srvuser -d /var/run/mysqld &&
   # install -v -o mysql -g srvuser -d /var/lib/mysql
   
   ## 网上说法是要touch pid文件
   
   # touch /var/run/mysqld/mysqld.pid
   ## 其实不必，如果my.cnf设置pid-file则需要对应的路径下有权限，如果没有设置，默认在datadir下，pid文件名为：hostname.pid, (hostname为运行系统的名称)
   ## 建立mysql client的socket，编译默认在/tmp/mysql.sock，而系统mysqld默认是在/var/run/mysqld/下面建立mysqld.sock的（可在my.cnf中配置)
   
   # ln -s /var/run/mysqld/mysqld.sock /tmp/mysql.sock
   ## 如果是在my.cnf中配置了client 和mysqld的 socket，直接指向同一个mysqld.sock的话（比如指向/tmp/mysqld.sock)，则可以不必在建立连接。

6. 配置好了之后，可以测试启动，使用mysqld_safe启动.
   

   # ./mysqld_safe --user=mysql >/dev/null 2>&1 &

7. 如果正常，则可以使用 mysqladmin设置一个本地密码：
   

   # ./mysqladmin -u root password <your-password-here>

8. 而后，关闭mysql，进行后继配置
9. 配置服务，其实很简单，找到文件mysql.server，并拷贝到/etc/init.d/下即可
   

   # cp /usr/local/mysql5.6.16/share/mysql/mysql.server /etc/init.d/mysql.server
   ## 如果你对启动项有修改，可以在这里面修改，比如我的datadir编译和初始化的时候不同，则可以在此修改datadir的值
   ## 完成这步之后，你可以使用:
   ## 启动mysql
   # service mysql.server start 
   ## 停止mysql
   # service mysql.server stop
   ## 重启mysql
   # service mysql.server restart

10. 设置启动运行和关机自动关闭mysql
    

    ## 这个仅需要建立两个连接即可,开机运行：
    # ln -s /etc/init.d/mysql.server /etc/rc3.d/S99mysql
    # ln -s /etc/init.d/mysql.server /etc/rc0.d/K01mysql

 配置MySQL完毕之后，启动MySQL服务，此时已经完成MySQL的编译安装的所有工作，接下来要做的是，使用root登录MySQL创建你需要的用户和库（表）。

注意：

$,#是终端提示符，##是注释

本文仅是Mitchell本人在CentOS(Linux)下编译安装MySQL5.6.16时的个人备忘，参考是可以，权威是没有的。